La rivalidad de Alianza Lima y Universitario de Deportes comienza desde el primer partido entre estos dos equipos en el año 1928, en un partido donde los hinchas blanquiazules eran gente obrera, gente del pueblo, mientras que los merengues eran estudiantes pudientes, este partido se jugó en el antiguo Estadio Nacional del Perú, la gresca comenzó por los jugadores quienes luego de ser expulsados ingresaron a la tribuna para pelear a puño limpio con los hinchas, mientras que los estudiantes hinchas de Universitario se defendían con sus bastones (comunes de la época) los morenos obreros hinchas de Alianza Lima se defendían con palos y lo que podían encontrar, debido a ello se denominó a este primer clásico como "El Clásico de los Bastonazos", a partir de ese día nació la eterna rivalidad entre estos dos equipos.
En la década de 1980, la Barra Sur, siendo en ese entonces la más radical tuvo fuertes enfrentamientos con los hinchas de Universitario. En esta década es cuando comenzó la época de violencia entre barras, que terminaban en desencadenadas grescas entre ambos bandos. Debido a que, muchas veces la Barra Sur hacia correr a los hinchas cremas es que comenzaron a llamarlos por el apelativo de "Gallinas" con el que los hinchas blanquiazules llaman hasta la actualidad a los merengues.
El 24 de setiembre del 2011, en un clásico jugado en el Estadio Monumental unos barristas de Universitario de manera violenta ingresaron a los palcos de la tribuna Sur así agrediendo a mujeres, niños y personas que se encontraban allí, pasaban de palco en palco arrasando con todo a su paso hasta que en el palco C-128 donde se encontraba un joven hincha de Alianza Lima de nombre Walter Oyarce, se detuvieron para agredir al sujeto, no bastándole con ello y en una acción totalmente repudiable, estos sujetos arrojaron al hincha blanquiazul desde el balcón del palco hasta la zona de la tribuna sur (aproximadamente 3 pisos) causándole graves daños y posteriormente la muerte.
El 17 de diciembre del 2006, el Comando Sur dio un duro golpe a su hinchada rival, la Trinchera Norte, ese día Universitario de Deportes jugaba un partido contra Unión Huaral en el Estadio Nacional del Perú, los integrantes de la barra crema llegaron temprano a la explanada Norte, estacionaron un vehículo en la que trasladaban sus bombos, tarolas, redoblantes, napoleones, murgueros, platillos y algunas banderas oficiales de la Trinchera Norte. Las cosas estaban esperadas para que, ingresaran los artículos al estadio, sin embargo, antes de esto llegaron los integrantes del Comando Sur e interceptaron a los integrantes de la Trinchera Norte, se desató una gresca en la calle entre ambos bandos, finalmente los victoriosos de esta pelea fueron los barristas del Comando Sur, robando casi toda la banda (tarolas, bombos, platillos y banderas oficiales) a la par que recuperaron una bandera que anteriormente habían perdido.