A lo largo del siglo XXI los equipos peruanos tuvieron participación en la Copa Libertadores o por la Sudamericana, estos son los partidos mas memorables de los equipos peruanos en la Copa, veamos los cuatro mas importantes en el siglo 21.
1. River Plate vs Cienciano
Por la final de la Copa Sudamericana se jugaba el partido de ida el 10 de diciembre del año 2003, en donde el equipo peruano empataba 3-3 al poderoso River plate, al minuto 26 Portilla ponía 1-0 para la visita, pero a los 18 minutos ponía el empate Maxi Lopez para el cuadro local, a los 46 minutos de vuelta Maxi López ponía 2-1, a los 67 German Carty empataba el duelo por 2-2, y a los 79 minutos Portilla ponía 3-2 para visitante, tras la agonía a los 85 Marcelo Salas puso el empate.
2. Alianza Lima vs Estudiantes
Un 18 de febrero del año 2010, se jugaba por la Copa Libertadores entre Estudiantes que era el campeón de la Libertadores 2009, se enfrentaba al equipo peruano, es uno de los partidos mas históricos que haya hecho un equipo peruano después del Cienciano, blanquiazules vencieron por 4-1 con tres goles de Wilmer Aguirre y un de José Carlos Fernández, a pesar que el equipo pincha vino como favorito a Lima, pero jamas de amilanaron y demostraron que el partido sea grabado para la hinchada blanquiazul.
3. Racing club vs Sporting Cristal
10 de marzo del 2015 el equipo peruano visitaba a Avellaneda por la Copa Libertadores, entonces en el cilindro el equipo limeño derrotaba por 2-1 con los goles de Carlos Lobatón a los 58 y 81, a los 67 Brian Fernández descontaba para el equipo Argenrtino.
4. Bolívar vs Alianza Lima
En la Copa Libertadores 2010 tuvo la campaña para los equipos peruanos no empezó como de costumbre pero el equipo blanquiazul tenía una dura prueba en la altura de La Paz, pero mostró su mejor versión en los últimos años en donde goleó de visitante a Bolivar en Hernando Siles con doblete de José Carlos Fernández y una de Montaño.
